John Armstrong Jr. (* 25. November 1758 in Carlisle, Provinz Pennsylvania; † 1. April 1843 in Red Hook, New York) war ein US-amerikanischer Offizier und Politiker. Er war ein Delegierter des Kontinentalkongresses, Senator von New York und Kriegsminister.
John Jr. war der Sohn von John Armstrong senior und Rebecca (Lyon) Armstrong. Nach seiner Schulzeit in Carlisle studierte er am College von New Jersey (heute Princeton University). Er unterbrach sein Studium in Princeton 1775 und ging nach Pennsylvania zurück, um sich dem Kampf um die amerikanische Unabhängigkeit anzuschließen.